cytoscape怎么标上调下调
发布网友
发布时间：2022-04-20 04:40
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热心网友
时间：2023-08-31 13:24
方法：
增加上下调关系，然后选中第一列删除重复项，将处理完的数据保存为TXT文件作为Table导入到Cytoscape中(这里要注意的是还要添加一-列Nodes2将其注释进去)先在Pubmed.上找了一个microRNA的数据包GSE72199[2]，GEO2R筛选了差异表达的microRNA:
随便找了P值zui小的5个，然后去TargetScan(http://www.targetscan.org/)上进行 了靶基因预测。(如果确实需要进行靶基因预测并进行验证的话，还是需要多个工具一起使用取交集的,常用的有TargetScan、Mirtrail、 Mirdb和MiRbase等)
