PyTorch Geometric(PyG)简易记录
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发布时间:2024-10-24 07:05
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时间:2024-10-24 08:30
PyTorch Geometric(PyG)是一个基于PyTorch的库,旨在提供图神经网络(GNN)的构建和训练功能。它支持多种与图数据相关的关键功能。
加载图数据时,以Cora数据集为例,展示了数据加载的过程。Cora数据集是图神经网络领域中的经典数据集,主要用于节点分类任务,代表了一个引文网络,节点为论文,边表示论文之间的引用关系。节点特征是论文的词袋描述,类别表示论文类型,共分为7类。
Cora数据集以PyG中的类形式呈现,包含单张图,节点数为2708,边数为10556,节点特征维度为1433。重要的是边表示方法,edge_index用于描述边,通过PyG函数转换成稀疏矩阵,展示为2708×2708的矩阵。
可视化图数据时,通常使用networkx与matplotlib工具。网络图中,大部分节点以蓝色显示,相互关联,周围则为孤立节点。
PyG实现GCN(简易版)主要通过调用库中的接口完成。值得注意的是,PyG内部结构不使用邻接矩阵torch.SparseTensor,而是通过edge_index和edge_weight进行计算。
在矩阵形式实现GCN(简易版)中,给定图的邻接矩阵和节点特征矩阵,使用矩阵表示GCN层中的参数和隐藏层特征。通常,GCN层的操作表达式为 [公式],其中 [公式] 表示参数, [公式] 表示隐藏层特征。
定义GCN层和模型结构,例如两层GCN,以Cora数据集为例进行简要使用。首先对邻接矩阵进行标准化,使用公式进行表示。